問題の調査
ターミナルを使ってサーバーに接続し、Yubikey内のGPGキーでGitコミットに署名しようとした際にエラーが表示されました。 簡単な調査内容：
有効な秘密鍵が存在するか確認：
gpg --list-secret-keys --keyid-format LONG
スマートカードが正しく読み取れるかテストする：
gpg --card-status
GPGを直接使って署名テスト：
echo "test" | gpg --clearsign
出力結果：
-----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE-----
Hash: SHA256
test
gpg: signing failed: Inappropriate ioctl for device
gpg: [stdin]: clear-sign failed: Inappropriate ioctl for device
エラーメッセージから、複数のターミナル環境ではGPGが現在使用している端末デバイスを自動認識できず、PINコードの入力プロンプトが正しくユーザーに伝わらないことが分かりました。 GPG_TTY環境変数の設定で修正を試みます：
export GPG_TTY=$(tty)
再度署名テストを行う：
認証ダイアログが正常に表示され、これで問題が解決されました。